O Museu está abrigado em uma stoa (um edifício com longas colunas) erguidas por Átalo II, rei de Pérgamo no século II A.C. É feita de mármore pentélico e pedra calcária e foi reconstruído pela Escola Americana de Estudos Clássicos em 1956. Em 1957, o estado Grego assumiu a administração e preparativos para ambos, o museu e o sítio arqueológico.
A Stoa de Átalo, que era algo semelhante a um centro comercial, foi reconstruída fielmente de acordo com a exata descrição pelos viajantes, e usando os mesmos materiais como aqueles que permaneceram em alguns pontos. As descobertas são mostradas em case ao longo do edifício e estão em ordem cronológica.
A coleção do museu, um dos mais importantes em Atenas, engloba as descobertas relacionadas a vida social e política do local da Agora. Este foi o centro efetivo da cidade por trinta e seis séculos, de 3000 A.C., a data do mais antigo que foi descoberto entre poços do período Neolítico, até o século VI D.C., quando Justinian fechou as Escolas de Filosofia e a Agora que estava abandonada.
O Museu conta com descobertas da Idade do Bronze, do Período Geométrico, do Período Helenístico, da era Romana, entre outros períodos importantes da história.
Cada andar tem duas alas e vinte e uma salas, as escadarias nas extremidades fazem a ligação entre os andares.
O Museu da Agora Antiga tem algumas esculturas marcantes como a estátua de Apollo Patroos, uma estátua colossal de culto por Euphranor (330 A.C.) bem como a figura alegórica feminina de dimensões monumentais, ou Themis ou Democracia, criada em frente a entrada real.
No piso superior da Stoa estão os modelos da Agora Antiga, a Acrópole e a Colina Pnyx (localizado entre a Agora e a Acrópole e onde era a assembléia da época).
Stoa de Átala, Agora Antiga
Diariamente das 08:00 às 15:00